Casualmente encontre un pequeño workaround para el mismo hasta tanto la gente de Eclipse genere el correspondiente parche, parece ser que bajo 9.10 eclipse no maneja correctamente los eventos de SWT.
la solución, crear el siguiente script, darle permiso de ejecución y utilizar el mismo para arrancar Eclipse.
#!/bin/sh
export GDK_NATIVE_WINDOWS=1
/home/eckenbre/programas/eclipse/eclipse
reemplazar /home/eckenbre/programas/eclipse/eclipse por el path de su eclipse.
Ahora que lo pienso, si agregamos la variable de ambiente GDK_NATIVE_WINDOWS=1 al .profile debería funcionar, lo cual seria una solución mas elegante.
Después lo pruebo, por ahora sigo que tengo que solucionar un tema en producción.

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